合工大有數學系，合肥工業大學數學學院是全國高校中開展數學建模最早的學院之一。合工大目前設有5個系、部，分別是：資訊與計算科學系、應用數學系、統計學系、大學數學教學部、工程數學教學部，設有3個本科專業：資訊與計算科學、數學與應用數學、統計學；擁有1個一級學科博士點：數學；擁有1個一級學科碩士點（數學），下設5個二級學科碩士點（基礎數學、計算數學、應用數學、概率論與數理統計、運籌學與控制論）；學院主辦了國家級學術期刊《大學數學》雜誌。
合肥工業大學數學學院的前身是合肥工業大學基礎部數學教研室。1985年由數學與力學兩部分合併成立應用數學力學系；1997年合肥工業大學與安徽工學院合併成立了新的合肥工業大學，兩校的數學、力學合併成立了新的應用數學力學系。1999年在學校的院系調整中，由應用數學力學系的數學部分和物理系合併成立理學院；2007年理學院分開成立了數學系，2009年4月撤銷數學系，成立數學學院。
