微生物的代謝，指微生物在存活期間的代謝活動。微生物在代謝過程中，會產生多種多樣的代謝產物。根據代謝產物與微生物生長繁殖的關係，可以分為初級代謝產物和次級代謝產物兩類。
微生物的代謝調節特點：
1、酶合成的調節：微生物細胞內的酶可以分為組成酶和誘導酶兩類。組成酶是微生物細胞內一直存在的酶，它們的合成只受遺傳物質的控制，而誘導酶則是在環境中存在某種物質的情況下才能夠合成的酶。例如，在用葡萄糖和乳糖作碳源的培養基上培養大腸桿菌，開始時，大腸桿菌只能利用葡萄糖而不能利用乳糖，只有當葡萄糖被消耗完畢以後，大腸桿菌才開始利用乳糖。
2、酶活性的調節：微生物還能夠通過改變已有酶的催化活性來調節代謝的速率。酶活性發生變化的主要原因是代謝過程中產生的物質與酶結合，致使酶的結構產生變化。這種調節現象在核苷酸、維生素的合成代謝中十分普遍。
