芒果有黑點主要是以下幾種原因形成的：
化學原因：芒果摘果的時候果膠流到果皮上，果膠腐蝕果皮，導致芒果的酚類物質氧化，形成黑點，黑點一般都比較小個，沒有影響到果肉，因此不影響食用。
物理原因：在儲運過程中，器械損傷、壓傷、凍傷，導致果皮破損，空氣中的氧氣跟芒果的酚類物質發生化合反應生成黑斑，一般在果皮上，不影響食用。
生物原因：芒果炭疽病，炭疽病在採果前25天以及採果後30天是發病高峰，炭疽病菌一般是在開花或者坐果的時候潛伏下來，有些芒果的抵抗力比較弱，所以在採摘前就發現了，這樣果會被遺棄掉，但是有些果抵抗力比較強，在果子後成熟階段，果子抵抗力變低，潛伏的炭疽病發作，形成黑斑，這個時候的芒果已經成熟了，所以比較甜，就會讓很多人誤認為出現黑點是芒果成熟的標誌，後成熟的芒果發生的炭疽病一般發生在果皮，對果肉沒有影響，同樣不影響食用。
長在芒果蒂上的黑斑叫做蒂腐病，病變部位發生在果蒂周邊，呈現黑色斑塊，如果病害嚴重會直接造成芒果腐壞，這個時候的芒果不能食用。
