不同的動產的抵押登記機關有：
1、企業裝置、原輔材料、產品或商品等，工商部門，《企業動產抵押物登記管理辦法》；
2、非農用機動車，車輛管理局，《機動車登記辦法》；
3、農用機器裝置，農機站；
4、農作物和其他農業收穫物，農業局；
5、果園、樹林，林業局；
6、船舶《海商法》所指，海事局《海商法》、《船舶登記條例》；
7、漁業船舶，漁政漁港監督管理局，《漁業船舶登記辦法》；
8、民用航空器，民用航空管理部門，《民用航空法》。
【法律依據】
國家工商總局《企業動產抵押物登記管理辦法》第一條規定，為加強對企業動產抵押物的登記管理，防止重複抵押，保障抵押債權的實現，根據《中華人民共和國擔保法》的有關規定製定本辦法。
