法院是不是古代的衙門

當然不是。不要說兩者之間不能比較，如果你非要比較，法院是就法律而裁決判決等的地方；而古代的衙門則是除了當時法律的執行裁判等外，還包括當時的政策執行等，它兼有了當時當地政府部門的職能，而現在的法院沒有那麼大的權利，更專一、更權威。