貸款政策的區別
公寓房按照商用貸款利率，首付5成，貸款年限一般不超過10年，貸款利率是基準率的1.1倍，而且不能使用公積金貸款，也不能因為購買公寓而提取公積金。而商品房首套住房則按照按揭貸款利率，首付三成，可以使用公積金貸款，貸款期長可達30年，不過如果是第二套房，首付則要6成，第三套房則停止貸款。
稅費的區別
商品房在營業稅、個稅、契稅等方面政策會有不同程度的減免，最低繳納2%-3%的稅費，而公寓房在目前少有減免政策，而且還增加了土地增值稅，通常稅費最低達到物業交易總價的10%。
產權年限的區別
因為商品房與公寓房的土地性質不同，產權年限也不一樣。公寓房土地出讓年限一般為40—50年，但是住戶的實際使用期限大多都要比公寓房土地使用證上的時間少得多；商品房使用年限一般為70年。
