1、變速箱不同：手動擋的車使用的是手動變速箱；自動擋的車使用的是自動變速箱。
2、駕駛方式不同：手動擋的車需要手動換擋；自動擋的車能自動切換到需要的擋位。
3、擋位標識不同：手動變速箱汽車的擋位標識為1、2、3、4、5、6、r；自動擋汽車變速箱的擋位標識為p、r、n、d。
4、操作原理不同：手動擋的車是手動變速器，用手撥動變速桿改變變速器內的齒輪齧合裝置，改變傳動比，達到變速的目的。自動擋的意思是不用駕駛者去手動換擋，車輛會根據行駛的速度和交通情況自動選擇合適的擋位行駛。
5、安全性不同：手動擋車的空擋使車失去了動力，行駛有安全隱患；自動擋車不能使用空擋行駛，這樣的方式行駛就比較安全。
