鮮奶和酸奶的蛋白質、脂肪及維生素等營養成分相差不大，二者可以相互替代。二者區別是：
酸牛奶的蛋白質和脂肪更易被人體吸收，鈣、磷、鐵等的利用率也大大提高。酸奶中的乳酸菌產生乳酸等有機酸，這些有機酸有效地降低了腸道的酸鹼度，從而可以有效地抑制腸道內有害病菌的繁殖。酸奶可使腸道內的有益細菌增加，維持腸道菌群的平衡。酸奶還可以促進唾液和胃液的分泌，增進食慾，增強腸胃消化功能，治療青少年便祕、消化不良等症。
但酸奶不能加熱喝，而牛奶可以加熱喝，對一些胃怕涼的人來說喝鮮奶比較合適。酸奶的含糖量高一些，不太適合胖人和正在減肥的人喝。嬰兒腸胃發育不健全，也不適合喝酸奶，最好喝牛奶。
另外，酸奶的酸性物質易腐蝕牙齒，飲後更要注意漱口。
酸奶比純奶更易於鈣的吸收
