將溼木耳表面的水分擦除或者晒乾，然後再儲存。最好儲存木耳口感的方法，就是撈出溼木耳，然後控幹水分，將表面的水氣擦乾，放置到有孔的籃子中，或者放在太陽下暴晒至幹木耳的樣子，這樣可以延長木耳的儲存期限，大約可以儲存3個月以上不變質，下次只需拿出泡發即可食用。
低溫可以降低細菌的繁殖速度，延長食物的儲存時間，將木耳放入保鮮盒密封好，然後放到冰箱儲存即可延長2天的儲存時間。
而新鮮黑木耳在料理前，需將蒂頭剪掉，並在水中浸泡5~10分鐘。偏好爽脆口感的人，可適度縮短浸泡的時間，來保持脆度。
如果買回家的是乾燥黑木耳，在料理前則需浸泡較久，約8小時左右才適合進行烹調處理。
