這個比賽專案的起源要從公元前490年9月12日發生的一場戰役講起。
這場戰役是波斯人和雅典人在離雅典不遠的馬拉松海邊發生的，史稱希波戰爭，雅典人最終獲得了反侵略的勝利。為了讓故鄉人民儘快知道勝利的喜訊，統帥米勒狄派一個叫菲迪皮茨的士兵回去報信。
菲迪皮茨是個有名的“飛毛腿”，為了讓故鄉人早知道好訊息，他一個勁地快跑，當他跑到雅典時，已上氣不接下氣，激動地喊道“歡......樂吧，雅典人，我們......勝利了”說完，就倒在地上死了。
為了紀念這一事件，在1896年舉行的現代第一屆奧林匹克運動會上，設立了馬拉松賽跑這個專案，把當年菲迪皮茨送信跑的里程——42、193公里作為賽跑的距離。馬拉松原為希臘的一個地名。在雅典東北30公里。其名源出腓尼基語marathus，意即“多茴香的”，因古代此地生長眾多茴香樹而得名。體育運動中的馬拉松賽跑就得名於此[1]。
