1、晚疫病。病害表現：苗期染病，病斑由葉片的主莖蔓延，嫩莖部縊縮腐爛，病部以上枝葉死亡，溼度大時病部表面產生白色黴層。
2、灰黴病。病害表現：主要危害花和果實，葉片和莖亦可受害。患部呈現水漬狀或黃褐色溼腐狀，表面長滿灰色至灰褐色濃密黴層。
3、綿腐病。病害表現：果實染病生水浸狀黃褐色或褐色大斑，致整個果實腐爛，但被害果外表一般不變形，有時果皮破裂。其病果一般不脫落，上密生大量綿絮狀白色黴層，而別於綿疫病。
4、棉鈴蟲。病害表現：幼蟲蛀食番茄植株的花、果，並且食害嫩莖、葉和芽。花蕾受害後，苞葉張開，變成黃綠色，2-3天后脫落，幼果常被吃空引起腐爛而脫落，成果期受害引起落果造成減產。
