1、礦質化是把複雜的有機質分解為簡單的化合物，最終變成無機化合物。
礦質化過程是進入土壤的有機肥料在微生物分泌的酶作用下，使有機物分解為最簡單的化合物，最終變成二氧化碳、水和礦質養分，同時釋放出能量。
2、腐殖化是把有機質礦化過程形成的中間產物合成為比較複雜的化合物。
腐殖化過程過程是在土壤微生物所分泌的酶作用下，將有機質分解所形成的簡單化合物和微生物生命活動產物合成為腐殖質。土壤腐殖質的形成一般分為兩個階段：第一階段，微生物將有機殘體分解並轉化為較簡單的有機化合物。第二階段，再合成組份，主要是芳香族物質和含氮的蛋白質類物質，縮合成腐殖質分子。
