由於廠家和製造工藝不同，蠔油的保質期也會有所差別。一般來說，蠔油保質期為2年左右，開封后放在冰箱冷藏儲存可儲存半年左右，如果儲存時間過長蠔油的風味會有所改變。如果開啟後的蠔油是放置在常溫下儲存，建議在三個月內食用完。
北方人多用醬油，而南方沿海人多用蠔油，以至於不少北方人來到南方後以為這是同一種東西的兩種稱謂，其實不然。簡單的講，二者的製作原料不同。蠔油：蠔油是以牡蠣為原料，經煮熟取汁濃縮，加輔料精製而成。蠔油味道鮮美、蠔香濃郁，黏稠適度，營養價值高，亦是配製蠔油鮮菇牛肉、蠔油青菜、蠔油粉面等傳統粵菜的主要配料。醬油：醬油分為釀造醬油和配製醬油。所謂釀造醬油、所謂配製醬油，其不同名稱有不同的含義。釀造醬油是指以大豆或脫脂大豆、小麥或麩皮為原料，經微生物發酵製成的具有特殊色、香、味的液體調味品。
