主要原因：
1、花菜在生長過程中可能因為雨水多或肥料不足感染黑斑病，黑斑病為貯藏中的主要病害，最初使花芽脫色，隨後變黑。
2、花菜在儲存的過程中會感染上甘藍鏈格孢菌，引起變質出現小黑點，即我們平時所說的發黴。
儲存方法：
1、常溫儲存，將花菜放在低溫、避光、通風的環境中，能延長花菜的保質時間，環境良好的情況下可以儲存一個星期。
2、低溫儲存，用保鮮膜將花菜包起來放進冰箱的保鮮層是最佳的儲存辦法，但不要放冷凍室中，溫度太低會將花菜凍壞。
在常溫下，花菜一般能儲存3到5天，用薄膜袋包裝低溫儲存的情況下，有實驗證明可以儲存長達兩個月，但家庭的儲存環境溫度和材料達不到實驗室標準，而且花菜從採摘到售賣也會有一段運送和儲存的時間，所以即使低溫儲存了也在10天以內食用為佳。
