絕大多數轉基因作物能正常留種，如轉基因大豆、轉基因棉花、轉基因玉米等一年生作物，這些作物目前還是以種子繁殖成本最低，這一類作物假設不能留種，那就要年年制種，並且每一株都要進行一次轉基因，成本極高，恐怕千萬元一畝地還收不回成本，天底下沒有人會蠢到這個地步！
但有一些轉基因植物是不能留種的，如轉基因毛白楊這樣的多年生木本植物，原因是毛白楊可以無性繁殖，不需要留種。將轉基因毛白楊進行三倍體處理後，將不能產生花粉，可以有效防止目標基因隨花粉傳播到其他同種植物上，這樣做是有好處的。
轉基因大豆比非轉基因大豆發芽更整齊！
