葵花籽沒有轉基因的。
目前用於做瓜子的向日葵主要是雜交品種，另有極少部分傳統品種，沒有轉基因品種。
葵花籽的雜交是三系，即不育系（母本）、恢復系（父本）、保持系（保持母本不育性狀）。轉基因是指將植物的優良遺傳性狀轉移到育種親本植物體內。目前葵花籽三系未能實現轉基因技術。
但是油葵（榨油用的葵花籽）中有“美葵“是轉基因的，它的產量高，個大勻稱，整齊一致，收購價高。據中國堅果炒貨委員會統計，平均每公斤“美葵”比“國葵”收益高0.5~1元。“國葵”由於常規品種退化問題沒有得到及時有效的改良，植株高矮不一、果實外觀不整齊，畝產低，從而削弱了自身的競爭力。
