1、不宜生吃，尤其是脾胃虛寒及月經期間的婦女。
如果只把番茄當成水果吃，補充維生素C，或盛夏清暑熱，則以生吃為佳。
2、不宜空腹吃，空腹時胃酸分泌量增多，因番茄所含的某種化學物質與胃酸結合易形成不溶於水的塊狀物，食之往往引起腹痛，造成胃不適、胃脹痛。
3、不宜吃未成熟的青色番茄，因含有毒的龍葵鹼。
食用未成熟的青色番茄，會感到苦澀，多吃了，嚴重的可導致中毒，出現頭暈、噁心、周身不適、嘔吐及全身疲乏等症狀，嚴重的還會發生生命危險。
4、不宜長時間高溫加熱，因番茄紅素遇光、熱、氧氣容易分解，失去保健作用，因此，烹調時應避免長時間高溫加熱。
