二套房按揭貸款申請和第一套會有一些不同，其具體說明如下：二套房貸款利率不低於貸款基準利率的1.1倍。大部分城市公積金貸款首付比例30%，商住房首付比例40%，利率執行二套房利率，基本不會低於9折，甚至是原利率。一般情況下，夫妻雙方中只要有任何一方已經購買過房產，現在再購買的，都屬於第二套房。
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二套房貸款利率較高有利於降低銀行信貸風險。可以降低房地產價格的漲幅。降低投資房產的意願，從而使高居不降的房價得到舒緩。縮小貧富差距。增進社會穩定。一般情況下商業銀行要在人民銀行公佈的基準利率6.55的基礎上上浮10%，也就是7.21%。根據國家規定，二套房房貸利率應是基準利率的1.1倍。商貸的基準利率為6.55%(10年期)，公積金貸款基準利率為4.5%。
