魚豆腐中含有修飾澱粉，澱粉的主要成分是磷酸，過量食用後容易對骨骼造成傷害。特別是青少年，食用過多會影響身體的生長髮育。
市面上的魚豆腐分為兩個版本，一種是以魚肉為主料，絞成魚泥後和其他輔料混合，然後擠壓成塊狀油炸而成的；另一種則是為了降低成本用澱粉和調味品加工出來的山寨魚豆腐。
不管是用魚肉製作的魚豆腐，還是調製出來的魚豆腐，本身都是沒有傷害的。但是調製的魚豆腐中，會含有修飾澱粉、大豆分離蛋白粉、小麥澱粉、調味劑、胡桃木煙燻液、結著劑、木糖、海藻糖以及甘氨酸等多種食品新增劑。
這些食品新增劑的存在，會使魚豆腐的口感更佳鮮美，而且還能增加魚豆腐的風味、延長儲存時長。但長期食用含有大量的新增劑的魚豆腐，會嚴重危害兒童的健康，而對成年人的傷害相對較小。
魚豆腐是近年來興起的魚肉類半成品方便食品，營養會比其他肉質半成品要高，味道鮮嫩可口，可用於火鍋、涮鍋、冷拼以及燉菜等烹飪過程中。
