蛋白質空間構象的特徵主要決定於

蛋白質的一級結構即蛋白質多肽鏈中氨基酸的排列順序決定蛋白質的空間構象，因為一級結構中包含著形成空間結構所需要的所有資訊，氨基酸殘基的結構和化學性質決定了所組成的蛋白質的二級結構的型別以及三級、四級結構的構象；二硫鍵和次級鍵都是維持蛋白質空間構象穩定的作用力，但不決定蛋白質的構象；溫度及pH影響蛋白質的溶解度、解離狀態、生物活性等性質，但不決定蛋白質的構象。