南京二手房滿兩年是要交個稅的，只有該二手房為家庭唯一住宅且購買時間超過5年（含5年），才不需要徵收個人所得稅，任何一個條件不滿足都必須繳納個人所得稅。地稅局會稽核賣方夫妻雙方名下是否有其他房產作為家庭唯一住宅的依據，其中包括雖然產權證沒有下放但是房管部門已經備案登記的住房（不包含非住宅類房產）。
如果是家庭唯一住宅但是購買時間不足5年則需要以納稅保證金形式先繳納，若在一年以內能夠重新購買房產並取得產權則可以全部或部分退還納稅保證金，具體退還額度按照兩套房產交易價格較低的2%退還。一般是稅率交易總額1%或兩次交易差的20%，如果所售房產是非住宅類房產則不管什麼情況都要繳納個人所得稅。個人所得稅也必須徵收差額的20%。
