紫菜泡水後變成紫紅色是因為掉色，因為裡面一種叫做“藻紅素”的色素，這種色素是溶於水的，在發泡過程中掉色就是正常的現象。
藻紅素是一種蛋白質類色素，受熱就會發生變性，紅色也就消失了。所以，平時煮紫菜湯的時候，煮熟後就沒有紅色了。失去藻紅素的紫菜就變成綠色，這是因為紫菜中還有大量的葉綠素。
紫菜在鮮活時本身就呈現深淺不同的紫紅色，也是因為細胞中含有藻紅素。由於藻紅素降解速率快，除了特別新鮮的紫菜會是紫紅色之外，一般的紫菜在經過加工、儲存和運輸之後只剩下了綠色的葉綠素，呈現綠色。所以，如果泡出來水是橘紅色，恰恰還說明這個紫菜比較新鮮。
