長期攝取的情況下，大劑量的咖啡因是一種毒品，能夠導致“咖啡因中毒”。咖啡因中毒包括上癮和一系列的身體與心理的不良反應，比如神經過敏，易怒，焦慮，震顫，肌肉抽搐(反射亢進)，失眠和心悸。另外，由於咖啡因能使胃酸增多，持續的高劑量攝入會導致消化性潰瘍，糜爛性食道炎和胃食管反流病。
切忌在空腹時喝咖啡，因為咖啡會刺激胃酸分泌，尤其是有胃潰瘍的人更應謹慎，而對於高血壓患者也應避免在工作壓力大的時候喝含咖啡因的飲料，因為咖啡中的咖啡因可能導致血壓上升，若再加上情緒緊張，就會產生危險的效果。咖啡作為一種飲品，飲用時，要根據個體情況適可而止，總的來說喝咖啡的好處和壞處各有很多，適量的飲用，產生的反作用並不大。
