1、製作豆腐時使用的凝固劑不同。普通豆腐用石膏做凝固劑，“內酯豆腐”使用一種叫“葡萄糖酸內酯”的東西作為凝固劑。
2、保質期不同。普通豆腐很難進行滅菌包裝，內酯豆腐可以進行超高溫滅菌，加入葡萄糖酸內酯之後，再裝盒密封。這樣得到的豆腐，保質期就遠比另外兩種豆腐要長。
3、口感不同。內酯豆腐的含水量更高，同樣的豆漿可以做出更多的豆腐來，豆腐的質地明顯要比滷水豆腐和石膏豆腐嫩滑與細膩。
4、鈣鎂含量不同。100克普通豆腐含蛋白質6.2克，脂肪2.5克，碳水化合物是2.4克，而鈣和鎂則分別是116毫克和36毫克。100克內酯豆腐含蛋白質6.2克，脂肪2.5克，碳水化合物是2.4克，而鈣和鎂則分別是116毫克和36毫克。
