會有影響，但不大，一些不耐熱的營養成分會流失，比如B族維生素之類，但牛奶中最重要的鈣不會流失，吃牛奶主要是補鈣。
袋裝牛奶加熱注意事項：
包裝食品的材料都必須經過有關部門的食品安全鑑定，所以說，袋裝牛奶的奶膜都有安全鑑定的證書，保證無毒無害，但這是指在正常使用下，而將袋裝牛奶帶袋直接高溫加熱是有害的，所謂高溫，是指溫度在100攝氏度以上。袋裝牛奶如果帶袋加熱，只要在100攝氏度以下，一般的塑料都不會產生問題，所以可用100攝氏度以下的開水燙溫奶袋，使牛奶溫熱。微波加熱和水加熱，對熱量傳遞方式不同。水加熱是從外向里加熱，而微波爐採取的是塑料分子正負極的碰撞，產生高熱，所以如果需要將牛奶在微波爐里加熱，如果包裝材料上沒有註明“可用微波爐加熱”的字樣，就都不能直接放入微波爐裡直接加熱，袋裝牛奶更不可以。
