洋蔥發芽後長出來的叫枝芽。
採收的洋蔥經乾燥處理後，能貯存較長時間不會發芽或黴爛。但未經乾燥處理或存放不當，也會發芽或腐爛，通常洋蔥在15攝氏度左右最容易發芽。發了芽的乃至長出青苗的洋蔥不會產生有害人體的物質，故仍可以吃。
但是，洋蔥發芽後鱗塊部分的營養物質會轉移到頂部供芽生長，致使營養成分下降。另外，洋蔥發芽後會影響其商品價值，其味也較辣。所以，應將洋蔥置於陽光下晒一段時間，然後放在通風乾燥處，儘量避免其發芽。
洋蔥的莖在營養生長時期，莖短縮形成扁圓錐形的莖盤，莖盤下部為盤踵，莖盤上部環生圓圈筒形的葉鞘和枝芽，下面生長鬚根。成熟鱗莖的盤踵組織幹縮硬化，能阻止水分進入鱗莖。
因此，盤踵可以控制根的過早生長或鱗莖過早萌發，生殖生長時期，植株經受低溫和長日照條件，生長錐開始花芽分化，抽生花薹，花薹筒狀，中空，中部膨大，有臘粉，頂端形成花序，能開花結實。頂球洋蔥由於花期退化，在花苞中形成氣生鱗莖。
